吉林大学学报(医学版) ›› 2013, Vol. 39 ›› Issue (1): 99-103.doi: 10.7694/jldxyxb20130123
甲状腺乳头状癌组织中差异表达miRNA及其靶基因的筛选和预测
贺梦子1，赵银龙2，刘晓冬1，马淑梅1，刘欣3
- 1. 吉林大学公共卫生学院 卫生部放射生物学重点实验室，吉林 长春 130021；2.吉林大学第二医院核医学科，吉林 长春 130041；3.吉林大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室，吉林 长春 130021
Screening and prediction of differential expression miRNA and their target genes in papillary thyroid carcinoma tissue
HE Meng-zi1,ZHAO Yin-long2,LIU Xiao-dong1,MA Shu-mei1,LIU Xin3
- 1.Key Laboratory of Radiobiology,Ministry of Health,School of Public Health,Jilin University,Changchun 130021,China;2.Department of Nuclear Medicine,Second Hospital,Jilin Univresity,Changchun130041,China;3.Department of Epidemiology and Health Statistics, School of Public Health,Jilin University,Changchun 130021,China
摘要： 目的：分析甲状腺乳头状癌组织中差异表达小分子RNA（miRNAs）并预测其靶基因，寻找影响甲状腺乳头状癌（PTC）发生发展及可用于生物标志物的miRNAs。方法：选取经病理证实的甲状腺乳头状癌组织及配对正常组织切除标本，运用高通量基因芯片的方法对差异表达的基因和miRNAs进行筛选，采用KEGG通路分析差异表达基因的功能，通过预测网站对差异表达miRNA进行靶基因预测，并对分析结果进行qRT-PCR验证。结果：与同源正常组织比较，基因芯片检测出PTC组织有248个miRNAs（ P<0.01）和3 631个基因差异表达（P<0.05）。hsa-miR-101［靶基因：整合素3(ITGA3）］已验证，癌组织中hsa-miR-101表达(59.8%)低于正常甲状腺组织， ITGA3表达（100%）高于正常甲状腺组织，并且与正常组织比较,59.8%PTC组织hsa-miR -101表达下调，同时ITGA3表达上调。结论：hsa-miR-101的靶基因可能为ITGA3，两者在PTC的发生发展中可能发挥重要作用。
中图分类号:
- R736.1