调控流感病毒基因片段的人编码microRNA的新方法

吉林大学学报(工学版) ›› 2011, Vol. 41 ›› Issue (6): 1704-1708.

调控流感病毒基因片段的人编码microRNA的新方法

刘元宁^1,2,李鑫^1,2,张浩^1,2,沈廷杰^1,2,李誌^1,3,田明尧⁴,鲁会军⁴

1.吉林大学计算机科学与技术学院|长春 130012；2.吉林大学符号计算与知识工程教育部重点实验室|长春 130012；3.长春理工大学计算机科学技术学院|长春 130022；4.军事医学科学院军事兽医研究所|长春 130062

收稿日期:2010-12-06 出版日期:2011-11-01 发布日期:2011-11-01
通讯作者: 张浩(1971-),男,副教授,博士.研究方向:生物信息学. E-mail:zhangh@jlu.edu.cn
作者简介:刘元宁(1962-),男,教授,博士.研究方向:生物信息学.E-mail:liuyn@jlu.edu.cn
基金资助:
国家自然科学基金项目（60971089）.

New method to discover human encoded microRNAs for regulating gene segments of influenza virus

LIU Yuan-ning^1,2, LI Xin^1,2, ZHANG Hao^1,2, SHEN Ting-jie^1,2, LI Zhi³, TIAN Ming-yao⁴, LU Hui-jun⁴

1.College of Computer Science and Technology, Jilin University, Changchun 130012, China|2.Symbol Computation and Knowledge Engineering of Ministry of Education, Jilin University, Changchun 130012, China|3.School of Computer Science and Technology, Changchun University of Science and Technology, Changchun 130022, China|4.Institute Military Veterinary, Academy of Military Medical Sciences, Changchun 130062, China

Received:2010-12-06 Online:2011-11-01 Published:2011-11-01

摘要/Abstract

摘要：

提出了基于流感病毒片段保守区的microRNA(简写为miR-CR）方法来寻找调控流感病毒的人编码miRNA。以H1N1流感病毒的HA、NA、NP、PB2、PA片段为例,最终得到7条能够调控以上5个片段的人编码miRNA,结果有待于进一步实验验证。本文的研究结果对于找出流感病毒致病性与传染性的变化规律以及流感病毒的靶基因药物设计具有重要意义。

关键词: 生物信息学, 流感病毒, 人编码microRNA, 保守区

Abstract:

A MiR-CR method was proposed based on conserved regions of influenza virus genes to discover human encoded miRNAs that regulate influenza virus. HA, NA, NP, PB2 and PA are taken as examples, seven human encoded miRNA are discovered. The result needs further experimental verification. Because the research of the miRNAs influenza gene expression in the infection is still in the early stage, the result of this work is of importance to discover the changing regularity of influenza pathogenicity and infection and apply in drug molecular design.

Key words: bioinformatics, human encoded miRNAs, influenza virus, conserved region

中图分类号:

TP399

刘元宁^1,2,李鑫^1,2,张浩^1,2,沈廷杰^1,2,李誌^1,3,田明尧⁴,鲁会军⁴. 调控流感病毒基因片段的人编码microRNA的新方法[J]. 吉林大学学报(工学版), 2011, 41(6): 1704-1708.

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