摘要:
提出一种采用递归神经网络模型构建基因调控网络, 将结构训练与参数训练相结合的方法进行网络的权值训练. 采用模拟退火算法训练网络结构, 找出调控关系权值, 再引入基于免疫思想的粒子群算法对权值进行参数优化, 得到基因调控网络图. 并分别用人工数据和大肠杆茵DNA修复系统基因数据进行实验. 实验结果表明, 该方法能有效地从基因时序数据中揭示基因间的调控关系.
中图分类号:
苏兰莹, 刘桂霞, 杨雅辉, 刘昱昊, 周春光. 采用结构与参数训练相结合的RNN模型构建基因调控网络[J]. J4, 2010, 48(02): 284-290.
SU Lan-Ying, LIU Gui-Xia, YANG Ya-Hui, LIU Yu-Hao, ZHOU Chun-Guang. Construction of Gene Regulatory Network via Recurrent NeuralNetwork Model Adopting Structure Combinedwith Parameter Training[J]. J4, 2010, 48(02): 284-290.