基于数据整合策略探究肌萎缩侧索硬化症易感基因

吉林大学学报(理学版) ›› 2022, Vol. 60 ›› Issue (2): 458-466.

基于数据整合策略探究肌萎缩侧索硬化症易感基因

杨翊研¹，宋佳玥²，曾琳琳²，付学奇²

1. 吉林大学校医院，长春130012;
2. 吉林大学生命科学学院， Edmond Fischer细胞信号传导实验室，长春130012

收稿日期:2021-05-18 出版日期:2022-03-26 发布日期:2022-03-26
通讯作者: 付学奇 E-mail:fxq@jlu.edu.cn

Exploringing for ALS Susceptibility Genes Based on Data Integration Strategy

YANG Yiyan¹, SONG Jiayue², ZENG Linlin², FU Xueqi²

1. School Hospital of Jilin University, Changchun 130012, China;
2. Edmond Fischer Signal Transduction Laboratory, School of Life Sciences, Jilin University, Changchun 130012, China

Received:2021-05-18 Online:2022-03-26 Published:2022-03-26

摘要/Abstract

摘要： 肌萎缩侧索硬化症（ALS）是一种以运动神经元凋亡为特征的神经退行性疾病，目前尚无有效的治疗方法和药物. 发现新的相关基因或靶点基因，对研究ALS的发病机制及临床治疗具有重要作用，为临床预防、诊断和治疗提供新的方向和目标. 从网站数据库搜集ALS相关基因的数据信息，通过多种致病基因预测工具软件进行生物信息学分析，并预测致病基因. 整合数据信息后得到39个候选基因. 结果表明，候选基因与ALS均有一定的相关性.

关键词: 肌萎缩侧索硬化症, 网络数据库, 易感基因, 基因预测工具

Abstract: Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) was a neurodegenerative disease characterized by motor neuron apoptosis. There was no effective treatment and drug at present. The discovery of new related genes or target genes played an important role in the study of pathogenesis and clinical treatment of ALS, and provided a new direction and target for clinical prevention, diagnosis and treatment. We collected the data information of ALS related genes from the website database, used a variety of pathogenic gene prediction tool software for bioinformatics analysis, and predicted the pathogenic genes. After the integration of data information, 39 candidate genes were obtained. The results show that the candidate genes have a certain correlation with ALS.

Key words: amyotrophic lateral sclerosis (ALS), network database, susceptibitity gene, gene prediction tool

中图分类号:

杨翊研, 宋佳玥, 曾琳琳, 付学奇. 基于数据整合策略探究肌萎缩侧索硬化症易感基因[J]. 吉林大学学报(理学版), 2022, 60(2): 458-466.

YANG Yiyan, SONG Jiayue, ZENG Linlin, FU Xueqi. Exploringing for ALS Susceptibility Genes Based on Data Integration Strategy[J]. Journal of Jilin University Science Edition, 2022, 60(2): 458-466.

[1]	苗启朋, 何丽莉, 姜宇, 白洪涛. 基于全局有向图的商品会话序列推荐算法[J]. 吉林大学学报(理学版), 2022, 60(2): 361-368.
[2]	石建平, 蔡雅倩, 关爽. 多功能全物理交联水凝胶的制备及性质[J]. 吉林大学学报(理学版), 2022, 60(2): 450-457.
[3]	刘婷, 张玉玲, 白雪, 王吉利, 宋和威, 丁杨. 火山渣负载土著氮细菌净化氨氮污染地下水特性[J]. 吉林大学学报(理学版), 2022, 60(2): 467-473.
[4]	梁丽娜, 胡加枫, 段朋虎, 毛东鹏, 朴云仙. 基于电化学活化的传感器构建及其电化学性能[J]. 吉林大学学报(理学版), 2022, 60(1): 182-0188.
[5]	万德龙, 孟旭东. 参数非凸弱广义Ky Fan不等式解映射的Lipschitz连续性[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1387-1394.
[6]	韩笑, 张敏行. 随机利率下的期权定价[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1405-1410.
[7]	郭文飞, 陶凯. Gevrey势能的离散拟周期 Schrodinger算子的非扰动Anderson局域化[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1419-1426.
[8]	张颖, 马承泽, 杨平, 王新民. 基于小波变换和改进PCA的人脸特征提取算法[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1499-1503.
[9]	王前, 沈慧娟. MX@CFO,C₃N₄@CFO和AC@CFO复合材料的构筑及光催化性能[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1539-1544.
[10]	张国平, 李顺心, 吕超, 徐颖. 基于聚酯棉布的可穿戴自供电长期稳定钙钛矿光电探测器[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1562-1568.
[11]	陈伟, 贾献峰. 纳米Al₂O₃/膨胀石墨的制备及吸附性能[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(6): 1587-1592.
[12]	王欢, 杨文, 马羽欣, 宋浩冉, 骆泽阳, 刘润茹. 前驱粉体低温烧结温度与压强对SDC电解质电学性能的影响[J]. 吉林大学学报(理学版), 2021, 59(5): 1278-1281.
[13]	张传美, 孟旭东. 含参集值向量均衡问题有效解下半连续的最优条件[J]. 吉林大学学报(理学版), 2020, 58(5): 1142-1148.
[14]	彭钟琪, 李媛, 薛益民. 一类非线性分数阶微分方程耦合系统边值问题的两个正解[J]. 吉林大学学报(理学版), 2020, 58(4): 775-781.
[15]	陈广秋, 王冰雪, 刘美, 刘广文. 基于结构信息相似度的线性投影灰度化算法[J]. 吉林大学学报(理学版), 2020, 58(4): 877-884.