吉林大学学报(医学版) 2020, 46(03) 464-469 DOI: 10.13481/j.1671-587x.20200306    ISSN: 1671-587X CN: 22-1342/R
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基础研究
乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因的网络分析
徐凤英1, 刘儒1, 马丽1, 曲一帆1, 肖伟利2, 王玉珍3, 谢基明2
1. 内蒙古医科大学研究生学院, 内蒙古 呼和浩特 010110;
2. 内蒙古自治区人民医院检验科, 内蒙古 呼和浩特 010010;
3. 内蒙古农业大学生命科学学院, 内蒙古 呼和浩特 010018
摘要：目的：探讨三阴性乳腺癌（TNBC） MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除后相关基因表达的变化，阐明Rab7a相关基因在TNBC中的作用。方法：选取对数生长期的乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞，采用Western blotting法检测乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞中Rab7a蛋白表达水平。慢病毒敲除TNBCMDA-MB-231细胞中Rab7a基因，分为阴性对照组和Rab7a基因敲除组，根据敲除的4种不同Rab7a序列分为KD1组、KD2组、KD3组和KD4组。采用qPCR法检测各组MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率，全基因表达谱芯片检测Rab7a基因敲除效率最高组（KD2组）和阴性对照组差异基因，一体化通路分析（IPA）软件分析Rab7a基因与其他基因的相互作用。结果：在TNBCMDA-MB-231细胞中可见Rab7a蛋白表达。与阴性对照组比较，KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率最高（P<0.01）；与阴性对照组比较，KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中有634个差异基因，其中上调基因和下调基因数均增多（P<0.01）；差异基因分析，Rab7a基因敲除与癌症、细胞存活、细胞周期和细胞生长及转移等有密切联系；Rab7a的IPA网络图中eIF4F、IRS1和RPS6KB1表达下调，PRKAA1、IKBKE、VEGFA和转录因子ATF2表达上调。结论：Rab7a基因在TNBCMDA-MB-231细胞中以基因网络的形式发挥作用；Rab7a基因与多基因相互作用，参与癌细胞的病理过程。
关键词： 乳腺肿瘤 Rab7a 三阴性乳腺癌 MDA-MB-231细胞 一体化通路分析
收稿日期  2019-06-04   修回日期    网络版发布日期  2020-06-11  
DOI: 10.13481/j.1671-587x.20200306
基金项目: 国家自然科学基金资助课题（81360394，31270922）
通讯作者: 谢基明,主任医师,硕士研究生导师(Tel:0471-3283999,E-mail:xclinton@sina.com)
作者简介: 徐凤英(1994-),女,内蒙古自治区呼和浩特市人,在读医学硕士,主要从事炎症的免疫与分子机制方面的研究。
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