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),杜艳1()2.云南省肿瘤医院 昆明医科大学第三附属医院血液科，云南 昆明 650118
3.云南省肿瘤医院 昆明医科大学第三附属医院检验科，云南 昆明 650118
构建急性髓系白血病（AML）相关的竞争内源性RNA（ceRNA）网络，探讨AML发生发展的分子机制。
采用NCBI的基因表达数据库（GEO）下载AML的表达矩阵（GSE96535），通过R语言的edgeR函数对差异表达的mRNA和长链非编码RNA（lncRNA）进行筛选。采用miRcode 、miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库预测差异表达的lncRNA与miRNA以及差异表达的mRNA与miRNA之间的调控关系。采用Cytoscape软件构建lncRNA-miRNA-mRNA的 ceRNA调控网络，采用基因本体论（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）对差异基因进行富集分析，采用CytoHubba插件筛选核心基因，即Hub基因。采用GEPIA数据库比较AML患者和正常对照者中前10个Hub基因的表达，绘制Hub基因的生存曲线。
与正常对照者比较，AML患者中有1 105个mRNA和387个lncRNA存在差异表达。构建的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络由45个lncRNAs、31个miRNA和89个mRNA组成。GO分析，差异基因所调节的功能主要有膜微结构域调节、谷氨酸受体结合和上皮细胞增殖调节等。KEGG分析，19条通路被富集，其中包括转录调控、蛋白聚糖调控和Ras信号通路等。通过CytoHubba共筛选出GATA 结合蛋白 3（GATA3）、WT1转录因子（WT1）和过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARG）等前10个连接度最高的Hub基因。采用GEPIA数据库验证GATA3、WT1、PPARG、MYB原癌基因（MYB）、性别决定相关的高迁移率基因群4（SOX4）和E2F7存在差异表达。E2F7低表达组患者生存率高于E2F7高表达组（P=0.028）。
筛选出的lncRNA、miRNA和mRNA所构成的ceRNA网络可能促进了AML的发生发展。