二云母花岗岩出露于冈底斯弧背断隆带上，沿色日荣—巴嘎东西向断层呈串珠状分布。岩石具有高SiO2、K₂O、Al2O3，低CaO的特点，A/CNK>1.1，并且标准矿物计算的刚玉质量均大于2.1%，为过铝质花岗岩，具深熔花岗岩特点，稀土和微量元素显示该岩石形成于同碰撞构造环境。SHRIMP锆石U-Pb定年结果表明，花岗岩继承锆石给出了少量太古宙和大量1120～1489Ma的年龄，代表了锆石主要源区的物质年龄，这与冈底斯带上念青唐古拉群原岩年龄基本一致，反映二者的亲缘性。有深熔特征的二云母花岗岩深熔时间为139Ma。结合区域资料，巴嘎区二云母花岗岩是在晚侏罗世时期由于新特提斯洋的俯冲作用及其弧后洋盆的闭合碰撞使冈底斯带地壳增厚熔融的结果。