吉林大学学报(医学版) 2021, 47(6) 1502-1509 DOI: 10.13481/j.1671-587X.20210621 ISSN: 1671-587X CN: 22-1342/R | ||
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临床研究 | ||
基于HMMR在肺腺癌组织中表达水平及其对LUAD患者预后影响的生物信息学分析 | ||
李书珍1,曹雅杰1,耿海营1,蔡曾晓瑞1,代春美2,温有锋3,4,李宁1,3,4(![]() |
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1.锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,辽宁 锦州 121000 2.锦州医科大学 药学院,辽宁 锦州 121000 3.锦州医科大学基础医学院人体解剖学教研室,辽宁 锦州 121000 4.辽宁省人类表型组学重点研究实验室,辽宁 锦州 121000 |
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摘要: 探讨透明质酸介导的细胞游走受体 (HMMR) 在肺腺癌 (LUAD) 组织中的表达及其对LUAD患者预后的影响,阐明HMMR在LUAD发生发展中的作用。 通过基因表达汇编(GEO)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和人类蛋白图谱(HPA)数据库评估LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平。采用GEPIA2数据库分析HMMR表达对LUAD患者总生存期(OS)和无病生存期(DFS)的影响,采用TCGA数据库分析HMMR mRNA表达与LUAD患者临床病理参数及预后的关系,采用GSEA富集分析探讨HMMR在LUAD组织中显著富集的通路,采用UALCAN数据库探讨HMMR mRNA表达与TP53基因突变的关系,采用STRING数据库预测HMMR与p53信号通路中蛋白的相互作用。 LUAD组织中HMMR mRNA和蛋白表达水平明显高于正常组织和癌旁组织(P<0.01)。HMMR mRNA表达水平较高的患者OS和DFS更短(P<0.01)。LUAD组织中,HMMR mRNA表达与患者TNM分期、T分期和N分期有关联(P<0.01)。单因素和多因素Cox分析,HMMR mRNA高表达的患者OS更短。GSEA富集分析,细胞周期、同源重组、p53信号通路、膀胱癌、胰腺癌、小细胞肺癌和泛素化介导的蛋白水解等通路显著富集在HMMR高表达显型。 LUAD组织中HMMR表达明显上调,高表达的HMMR mRNA是LUAD患者预后差的独立评价指标。 |
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关键词: 肺腺癌 透明质酸介导的运动受体 数据库 预后 | ||
收稿日期 2021-04-29 修回日期 网络版发布日期 2021-12-14 | ||
DOI: 10.13481/j.1671-587X.20210621 | ||
基金项目: 国家自然科学基金项目(31400646);辽宁省教育厅高等学校创新人才项目(LR2019028) | ||
通讯作者: 李宁 | ||
作者简介: 李书珍(1993-),男,河南省驻马店市人,在读硕士研究生,主要从事肺腺癌基础方面的研究。 | ||
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