实时荧光定量PCR法对ICU患者痰液标本中鲍曼不动杆菌耐药基因的检测及其评价

doi:10.13481/j.1671-587X.20220631

吉林大学学报(医学版) ›› 2022, Vol. 48 ›› Issue (6): 1623-1628.doi: 10.13481/j.1671-587X.20220631

实时荧光定量PCR法对ICU患者痰液标本中鲍曼不动杆菌耐药基因的检测及其评价

马亚楠¹,谭兵¹,徐磊²,张健东¹()

^1.天津市第三中心医院检验科天津市重症疾病体外生命支持重点实验室天津市人工细胞工程技术研究中心天津市肝胆研究所，天津 300170
^2.天津市第三中心医院重症医学科，天津 300170

收稿日期:2022-01-23 出版日期:2022-11-28 发布日期:2022-12-07
通讯作者: 张健东 E-mail:zhangjiandong211@126.com
作者简介:马亚楠（1987－），女，天津市人，副主任技师，医学硕士，主要从事微生物细菌鉴定和PCR实验室检测方面的研究。
基金资助:
天津市卫健委科技人才培育项目(KJ20134);天津市卫健委医学重点学科（专科）建设项目(TJYXZDXK-047A)

Detection of drug resistance genes of Acinetobacter baumannii in sputum samples of ICU patients by real-time fluorescence quantitative PCR method and its evaluation

Yanan MA¹,Bing TAN¹,Lei XU²,Jiandong ZHANG¹()

^1.Department of Laboratory Medicine，Tianjin Third Central Hospital，Tianjin Key Laboratory of Extracorporeal Life Support for Critical Diseases，Tianjin Artificial Cell Engineering Technology Research Center，Tianjin Institute of Hepatobiliary Disease，Tianjin 300170，China
^2.Department of Critical Care Medicine，Tianjin Third Central Hospital，Tianjin 300170，China

Received:2022-01-23 Online:2022-11-28 Published:2022-12-07
Contact: Jiandong ZHANG E-mail:zhangjiandong211@126.com

摘要/Abstract

摘要：

目的探讨重症监护病房（ICU）患者感染鲍曼不动杆菌（AB）的碳青霉烯类药物耐药情况，阐明实时荧光定量PCR（RT-qPCR）法进行耐药基因检测的临床应用价值。方法收集ICU患者的痰液标本285份，分别进行传统培养鉴定药敏和RT-qPCR耐药基因检测。统计分析耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌（CRAB）检出率、耐药基因检测的符合率和其他抗菌药物的耐药情况。结果共检出AB 151株，检出率为52.98%。AB对碳青霉烯类药物耐药率为72.20%。采用RT-qPCR法检测OXA-51基因检出AB的符合率与传统培养方法比较差异无统计学意义（P>0.05）。OXA-23基因检出CRAB的符合率与传统培养方法比较差异无统计学意义（P>0.05）。108株AB感染OXA-23阳性标本对米诺环素、头孢哌酮/舒巴坦、黏菌素和替加环素的耐药率较低。结论 ICU患者痰液标本培养鉴定出AB的耐碳青霉烯类药物的检出率高。与传统培养方法比较，RT-qPCR法更简便、快速，且检测符合率更高。CRAB对米诺环素、头孢哌酮/舒巴坦、黏菌素和替加环素的耐药率低。

关键词: 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌, 重症监护病房, 耐药基因, 实时荧光定量PCR

Abstract:

Objective To investigate the carbapenem drug resistance of the intensive care unit（ICU） patients infected with Acinetobacter baumannii（AB）， and to clarify the clinical application value of real-time fluorescence quantitative PCR（RT-qPCR） method for the detection of drug resistance genes. Methods A total of 285 sputum specimens from the ICU patients were collected for identification of the drug susceptibility by traditional culture method and detection of the drug resistance genes by RT-qPCR method. Statistical analysis was performed on the detection rate of the carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii （CRAB）， the coincidence rate of the drug resistance gene detection and the drug resistance of other antibiotics. Results A total of 151 strains of AB were obtained， the detection rate was 52.98%. The drug resistance rate of AB to carbapenem was 72.20%.There was no significant difference in the coincidence rate of OXA-51 gene detected by RT-qPCR method compared with the traditional culture method（P>0.05）. There was no significant difference in the coincidence rate of CRAB detected by OXA-23 gene compared with the traditional culture method （P>0.05）.The drug resistance rates of 108 OXA-23 positive specimens infected with AB to minocycline，cefoperazone/sulbactam， myxin，and tegacyclin were lower. Conclusion The detection rate of carbapenem resistant drugs of AB identified by sputum culture of the ICU patients is high. Compared with traditional culture method， RT-qPCR method is simpler， faster and has a higher consistent rate of detection.The drug resistance rates of CRAB to minocycline， cefoperazone/sulbactam， myxin and tegacyclin are low.

Key words: Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, Intensive care unit, Drug resistance gene, Real-time fluorescence quantitative PCR

中图分类号:

R446.5

马亚楠,谭兵,徐磊,张健东. 实时荧光定量PCR法对ICU患者痰液标本中鲍曼不动杆菌耐药基因的检测及其评价[J]. 吉林大学学报(医学版), 2022, 48(6): 1623-1628.

Yanan MA,Bing TAN,Lei XU,Jiandong ZHANG. Detection of drug resistance genes of Acinetobacter baumannii in sputum samples of ICU patients by real-time fluorescence quantitative PCR method and its evaluation[J]. Journal of Jilin University(Medicine Edition), 2022, 48(6): 1623-1628.

图/表 2

参考文献 20

1	宋晓萍. ICU鲍曼不动杆菌耐药性及相关耐药基因的检测［D］. 青岛：青岛大学， 2012.
2	NOWAK P， PALUCHOWSKA P. Acinetobacter baumannii： biology and drug resistance-role of carbapenemases［J］. Folia Histochem Cytobiol， 2016， 54（2）： 61-74.
3	CONSALES G， GRAMIGNI E， ZAMIDEI L， et al. A multidrug-resistant Acinetobacter baumannii outbreak in intensive care unit： antimicrobial and organizational strategies［J］. J Crit Care， 2011， 26（5）： 453-459.
4	孙恒彪. 采用多重PCR及高分辨熔解曲线分析技术快速检测多重耐药鲍曼不动杆菌4种耐药基因及其临床应用的研究［D］. 广州：南方医科大学， 2017.
5	朱秋丽，卫菊，胡丹，等. 耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌下呼吸道感染的危险因素研究［J］. 中国消毒学杂志， 2019， 36（5）： 359-361， 364.
6	JAIN M， SHARMA A， SEN M K， et al. Phenotypic and molecular characterization of Acinetobacter baumannii isolates causing lower respiratory infections among ICU patients［J］. Microb Pathog， 2019， 128： 75-81.
7	邓德耀，袁文丽，刘春林. OXA-51型β内酰胺酶的研究进展［J］. 中国感染与化疗杂志， 2014， 14（5）： 451-454.
8	杨玉莹. 医院内鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类药物耐药的流行播散规律与临床特征研究［D］. 沈阳：沈阳医学院， 2018.
9	Clinical and Laboratory Standards Institute. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing ［S］.29th ed.CLSI supplement M100.Wayne，PA：Clinical and Laboratory Standards Institute，2019.
10	解建茹，姚燕，郝永刚，等. 我院耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌感染的危险因素分析［J］. 中国实用医药， 2020， 15（32）： 150-153.
11	林雪霏，蒋月婷，邓颖珊，等. 不同耐药性鲍曼不动杆菌耐药特征及常见耐药基因检测分析［J］. 国际检验医学杂志， 2020， 41（22）： 2765-2769.
12	LIU S， HUANG G T， GONG Y L， et al. Rapid and accurate detection of carbapenem-resistance gene by isothermal amplification in Acinetobacter baumannii ［J］. Burns Trauma， 2020， 8： tkaa026.
13	韩丽明. 承德市2011年-2016年AB耐药变迁及CRAB耐药基因分析［D］. 唐山：华北理工大学， 2018.
14	ABOUELFETOUH A， TORKY A S， ABOULMAGD E. Phenotypic and genotypic characterization of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Egypt［J］. Antimicrob Resist Infect Control， 2019， 8： 185.
15	JIANG M J， MU Y Q， LI N， et al. Carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii from air and patients of intensive care units［J］.Pol J Microbiol，2018，67（3）： 333-338.
16	张梓岗，于海娟，戴晓玥，等. 我院鲍曼不动杆菌携带bla_OXA-23基因及其耐药机制研究［J］. 国外医药（抗生素分册）， 2021， 42（1）： 24-28.
17	史政. 替加环素联合头孢哌酮钠舒巴坦用于鲍曼不动杆菌所致肺部感染患者的临床效果［J］. 医疗装备， 2021， 34（2）： 112-113.
18	李璐，王真珍，唐苏予. 米诺环素与替加环素治疗重症肺炎患者临床观察［J］.社区医学杂志，2020，18（19）： 1336-1339.
19	孔海芳. 临床分离耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌耐药机制及流行病学研究［D］. 天津：天津医科大学， 2017.
20	徐益，高辉，王佳，等. 重症监护病房耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌6种耐药基因检测［J］. 中国抗生素杂志， 2021， 46（1）： 72-75.

Antibacterial drug	OXA-23 gene positive(n=108)		OXA-23 gene negative(n=34)
Antibacterial drug	No.of resistant strains	Resistance rate（η/%）	No.of resistant strains	Resistance rate（η/%）
Gentamicin	88	81.48	13	38.24
Amikacin	87	80.56	8	23.53
Tobramycin	93	86.11	9	26.47
Piperacillin	94	87.04	9	26.47
Piperacillin/Tazobactam	89	82.41	8	23.53
Ticarcillin/Clavulanate	98	90.74	11	32.35
Ceftriaxone	91	84.26	9	26.47
Cefotaxime	92	85.19	9	27.03
Ceftazidime	97	89.81	9	27.03
Cefepime	98	90.74	9	27.03
Meropenem	99	91.67	11	32.35
Imipenem	99	91.67	11	32.35
Ciprofloxacin	88	81.48	8	23.53
Levofloxacin	86	79.63	8	23.53
Minocycline	40	37.04	7	20.69
Cotrimoxazole	78	72.22	9	26.47
Aztreonam	93	86.11	10	29.41
Cefoperazone/Sulbactam	44	40.74	7	20.69
Colistin	0	0	0	0
Tigecycline	10	9.26	3	8.82

[1]	冶秀兰, 李明, 王兆建, 赵海燕, 马建宁, 刘婧, 郑怡, 李顺清, 张玉. 山茱萸多糖对难治性癫痫幼鼠行为学和海马组织中多药耐药基因1b及主穹隆蛋白表达的影响[J]. 吉林大学学报(医学版), 2021, 47(3): 644-651.
[2]	周浩泉, 储新民, 戴媛媛, 代传林, 潘家华. 婴幼儿非发酵菌感染的临床特征和耐药分析[J]. 吉林大学学报(医学版), 2017, 43(05): 975-979.
[3]	杨麒巍, 杜珍武, 于杉, 高素洁, 赵冠杰, 张琳, 卢佳, 任明, 张桂珍. 孕妇血浆DNA中内参基因拷贝数稳定性的评价[J]. 吉林大学学报(医学版), 2016, 42(03): 523-529.
[4]	邢洪源, 赵婧, 刘纯岩, 李贺, 刘扬, 王珍琦. LPL基因mRNA在精神分裂症模型大鼠脑组织中的表达[J]. 吉林大学学报(医学版), 2016, 42(01): 11-14.
[5]	刘换新,白义凤,王炜,郭琳琅. LRIG1和 EGFR mRNA在非小细胞肺癌患者外周血中的表达及其临床意义[J]. 吉林大学学报(医学版), 2014, 40(02): 363-368.
[6]	王文越，黄文君，潘颖，李析茜，曹林林，张纪存，杨麒巍. 子宫内膜癌患者外周血细胞CK20 mRNA的表达及其临床意义[J]. 吉林大学学报(医学版), 2013, 39(5): 960-964.
[7]	曹健，王瑞，侯进. 乳腺癌组织中神经营养因子Neuritin的表达及其临床意义[J]. 吉林大学学报(医学版), 2013, 39(4): 799-803.
[8]	孙亚东\|张景斌\|杨乐\|马彦\|姜春浩\| 邸军 . 实时荧光定量PCR法检测EG-1在甲状腺乳头状癌组织中的表达及其临床意义[J]. J4, 2012, 38(5): 981-984.
[9]	曲红光\|高磊\|贺丹\|刘聪\|燕巍\|高嵩\|王丽. 灵芝多糖逆转卵巢癌细胞株顺铂耐药的作用及其机制[J]. J4, 2011, 37(2): 250-254.
[10]	雒伟伟, 邢沈阳, 赵志辉, 张西臣. 转录因子FOXD1在乳腺癌组织中的表达及意义[J]. J4, 2010, 36(4): 703-707.
[11]	曾飞跃, 王延金, 陈风华, 杨转移, 邓永文, 方加胜. MDR1在人脑肿瘤干细胞中的表达及意义[J]. J4, 2009, 35(5): 769-773.
[12]	杨冬艳, 张宏宇, 孔晓霞, 孙连坤, 史纪文. 白血病耐药细胞中多药耐药基因MDR1与核转录因子κB的关系[J]. J4, 2009, 35(4): 650-655.

实时荧光定量PCR法对ICU患者痰液标本中鲍曼不动杆菌耐药基因的检测及其评价

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